Western Blot 实验注意事项

2022-06-12

一. 蛋白样品的制备

       按组织净重(g):裂解液体积(ml)=1:10 的比例加入相应体积的裂解液(加入终浓度为 1mM 的 PMSF,适当浓度的蛋白酶抑制剂和磷酸化酶抑制剂,以避免内源性酶分解蛋白, 影响蛋白质的抽提)进行匀浆。

       蛋白质的样品制备是 western blotting 的第一步,也是关键步骤,要求可获得所有蛋白 质,应注意以下问题:

       (1) 在合适的盐浓度下,应保持蛋白质的最大溶解性和可重复性。

       (2) 选择合适的表面活性剂和还原剂,破坏所有非共价结合的蛋白质复合物和共价 二硫键,使其形成各自多肽的溶液。

       (3) 尽量去除核酸,多糖,脂类等分子的干扰,在裂解完毕离心之后小心取中层澄 清溶液,注意不要吸到底层沉淀和上层脂类。

       (4) 防止蛋白在处理过程中的人为修饰,制备过程必须在低温下进行,以避免细胞 破碎释放出各种酶类的修饰。(可以加入 PMSF 等酶抑制剂)

       (5) 样本制备完后分装保存,但是注意不要反复冻融

 

二. 凝胶的制备 

       均一胶的制备,分子量较小的蛋白选用较大浓度的凝胶。

       30%的 PAG 配置完后过滤于 4℃保存。10%SDS 室温保存。AP 不稳定,用时现配。

       制胶关键是聚合时间,分离胶聚合控制在从加入 10%AP 和 TEMED 至开始凝胶,时间 为 10-20min(未完全凝聚)。浓缩胶最佳聚合时间为 8-10min。可通过控制 AP 和 TEMED 量来控制。AP,TEMED 的量过高,局部胶凝的太快,会使凝胶不均匀,电泳蛋白条带会 弯曲。环境温度较高时,应减少 AP,TEMED 的量。 空气中氧气也会影响胶的聚合,所以 在分离胶上面应加一层水或正丁醇以隔绝氧气。

 

三. 电泳常见问题:

       (1) 条带出现“微笑”现象(中间凹两边翘起):主要是凝胶中间部分凝固不均所致, 应待凝胶充分凝固后电泳,或者催化剂加入后充分混匀。

       (2) 条带出现“皱眉”现象(中间鼓坡两边向下):两玻璃板之间底部气泡所致,应 排除底部气泡。

       (3) 带出现拖尾现象:主要是样本溶解效果不佳;分离胶浓度过大,电泳缓冲液放置时间过长。建议:加样前离心,选择适当的样本缓冲液,加适量的样品促溶 剂;使用新配置的电泳缓冲液,降低凝胶浓度或使用梯度凝胶。

       (4) 蛋白条带出现纹理现象:样品不溶性颗粒引起的。建议:加样前离心,加入适 量的促溶剂。

       (5) 指示的溴酚蓝已跑出底板,但蛋白质未跑下来:与缓冲液和分离胶的浓度有关。 应更换正确 PH 值的缓冲液,降低凝胶浓度或使用梯度凝胶

 

四. 转印

       湿式电转印注意事项:

       (1) 要使蛋白质组分能有效的从凝胶转移到固相纸膜上,缓冲液的 PH 值很重要。 有些分子量不是很大的蛋白质区带,即使延长电转印时间也不能从凝胶转移到 膜上。这是由于蛋白质在转移缓冲液中恰好处于等电点状态造成的,因此应适 当改变转移缓冲液的 PH,以利于转膜。另外,对于分子量较小的蛋白质,可 在缓冲液中加入适量甲醇,因为甲醇能促进它们固定在固相膜上。但是对于大 分子量的蛋白质,尤其是碱性蛋白质,缓冲液中是不宜加入甲醇的,因为甲醇 使凝胶孔径变小,不利于分子量较大的蛋白的转移,甲醇能将结合在碱性蛋白 质上的 SDS 解离出来而使其带正电或呈电中性,蛋白质就更难从凝胶中转移出 来。

       (2) 电转印膜的选择:有 NC 膜,重氮化膜和阳离子尼龙膜,PVDF 膜。其中 NC 膜使用的最为普遍,它的蛋白质容量大,可用各种染色方法进行检测,但是它 与蛋白质的结合是非共价性的,膜干燥后很脆。此外膜的孔径大小也是考虑的 重要因素,目的蛋白 30KD 以下用 0.22um 孔径的 NC 膜,30KD 以上用 0.45um 孔径的 NC 膜。

       (3) 转印选择恒流,每个转印槽 150mA,10KD 以下转印 40min,10-30kd 转印 50min, 30-100KD 转印 70min,100kd 以上转印 80min,转印完毕可用丽春红 S 染膜, 检测转印是否成功,转印结束后,去除 NC 膜置于丽春红 S 溶液中,室温 5-10min 即可看见红色条带,用 TBS 洗数次即可洗掉红色条带进行后续实验。

 

五. 封闭

       (1) 电泳转膜过后,膜上其他没有结合蛋白质的空白位置需要用封闭液加以封闭, 以避免一抗或二抗非特异性结合。这是由于 WB 的灵敏度很大程度上取决于封闭的好坏,封闭时间过长(过度封闭)导致抗原表位的遮蔽,从而降低检测灵 敏度;封闭时间过短(不完全封闭)又会导致最终背景增高或信噪比太低,因 此封闭液的选择和条件的优化很重要。

       (2) 封闭液中应加入适量的防腐剂,避免封闭蛋白变性影响封闭效果。

 

六. 抗体的杂交

       (1) 若非特异性条带过多,可适当降低抗体的浓度,增加洗膜次数,蛋白电泳前延 长变性时间,减少上样蛋白量,延长封闭时间。

       (2) 若信号弱,可能转膜不完全,可优化转移时间和电流,增加抗体的浓度,适当 延长曝光时间。

       (3) 若背景较高,可适当降低抗体的浓度,过滤二抗,延长封闭时间,增加漂洗时 间,减少曝光时间。

 

七. 检测

       (1) 胶片曝光几秒到数分钟,具体情况要看膜上化学发光条带明暗强度而定。胶片 曝光时间不宜过长,时间过长会照成胶片背景变深。冲洗胶片以确定所测抗原 的正确曝光时间。

       (2) 冲洗胶片的步骤:曝光完的胶片先在显影液中冲洗至出现条带为止,一般在 1min 以内,时间过长也会照成胶片背景变深。再放入定影液中漂洗,十秒即可。 显影液漂洗完后,要多用清水冲洗,以免定影液中成分残留在胶片上。