WB 实验流程通常包括样本制备、电泳、转膜、封闭、抗体孵育和检测 6 个部分。这 6 个部分是环环相扣,每一步的疏忽都可能导致一无所获。
1、样本选择和处理
蛋白分子参与生命活动的各个过程,其功能复杂多样,有些蛋白可能只在部分组织和细胞表达(图1)。有些蛋白可能需要诱导,才能表达或表达量增加(图2)。有些蛋白可能存在翻译后修饰,导致其蛋白分子量大小可能与预测不符(图2,3)。有些蛋白可能有多个异构体或者容易被降解,导致出现多条条带的现象(图2)。因此,只有足够了解您研究的蛋白特性,您才能在样本的选择和处理上得心应手,美美的开启您的 WB 之旅。
2、样本制备
样本制备是 WB 实验的开端,裂解液的选择、样本的破碎方法、温度和变性等都会影响样本制备是否成功。
以下是一些样本制备过程中需关注的小细节:
超声处理富集THP-1细胞中的Histone H3蛋白。 Lane 1:超声处理THP1全细胞裂解液; Lane 2:未处理THP-1全细胞裂解液。 |
3、电泳
电泳可以将靶标蛋白与其它蛋白分开,更易检测。不同浓度的分离胶对不同分子量的的蛋白分离效果是不同的。蛋白的上样量,也会影响是否可以检测到有效信号或者获得漂亮的图片。设置阳性和阴性对照不仅有助于分析蛋白功能,在WB实验失败时也有助于分析失败的原因。
在电泳时需要特别关注以下小细节:
蛋白的分子量大小 |
分离凝胶丙烯酰胺百分比 |
4–40 kDa |
20% |
12–45 kDa |
15% |
10–70 kDa |
12.5% |
15–100 kDa |
10% |
25–200 kDa |
8% |
4、转膜
转膜是指将蛋白从电泳胶上转移到膜上,方便目标蛋白的检测。转膜缓冲液中SDS和甲醇含量对不同分子量蛋白的转膜影响是不同的。PVDF膜孔径的选择依赖于蛋白分子量大小。转膜结束后,丽春红染色使蛋白可视化,方便判断转膜是否成功。
甲醇浓度对转膜效率的影响。HeLa全细胞裂解液中DNA PKcs蛋白检测。 Lane 1: 转膜缓冲液中甲醇浓度10%; Lane 2: 转膜缓冲液中甲醇浓度20%。 |
丽春红染色判断转膜是否成功。左图:转膜成功;右图:转膜失败。 |
在转膜时需要特别关注以下小细节:
5、封闭
封闭是使未有蛋白吸附的区域被封闭,以防止抗体的非特异性结合,从而降低背景,提高检测灵敏度。常用的封闭液有5%脱脂奶粉和5% BSA或特定封闭液。
在封闭时需要特别关注以下小细节:
使用ab32034检测p27 KIP1时,不同封闭液封闭效果不同。 Lane 1: 2% BSA; Lane 2: 5% BSA; Lane 3: 5% NFDM/TBST。 |
6、抗体孵育
抗体孵育通常包括一抗孵育和二抗孵育,一抗可特异性地和靶蛋白相互结合;二抗能辨认一抗的恒定区(具有物种特异性),具有放大信号的作用。
在抗体孵育时需要特别关注以下小细节:
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组织培养上清 |
腹水 |
全抗血清 |
纯化的抗体 |
WB |
1/100 |
1/1000 |
1/500 |
1g/ml |
浓度估计 |
1-3mg/ml |
5-10mg/ml |
110mg/ml |
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7、检测
二抗通常带有标签,以用作检测。常见检测手段有化学发光和荧光标记等。
在检测时需要特别关注以下小细节:
化学发光检测
荧光检测